تایپینگ E. coli های جدا شده از نمونه‌های آب سطحی ورودی به تصفیه‌خانه‌های شهر تهران به روش ERIC-PCR

  چکیده   سابقه و هدف: تایپینگ سویه‌های باکتریایی، یکی از روش‌های مطالعه‌ی اپیدمیولوژیک است. بدین منظور در این تحقیق از تکنیک ERIC-PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی سویه‌های E. coli جدا شده از آب ورودی به تصفیه‌خانه‌های شهر تهران استفاده شد .   مواد و روش‌ها: تعداد 106 ایزوله E. coli طی دوره‌ی یک ساله، از بین 1939 نمونه ورودی تصفیه‌خانه‌های آب شهر تهران مطابق با روش‌های استاندارد جداسازی شد و با روش ERIC PCR اثر انگشت ژنومیک آنها تعیین و با رسم دندروگرام بر اساس UPGMA ، خوشه‌های ترسیمی مورد ارزیابی قرار گرفت .   یافته‌ها: تعداد 106 ایزوله E. coli وارد این تحقیق شد و از بابت توالی‌های ERIC ، مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که راندمان ERIC-PCR در تعیین اثر انگشت بسیار بالا است، چرا که همه‌ی سویه‌ها با این روش قابل تایپ‌بندی بودند. در مجموع، تعداد 32 باند در محدوده‌ی 163 تا 3200 به‌دست آمد که به ‌واسطه‌ی آنها، سویه‌ها در 9 خوشه قرار گرفتند .   نتیجه‌گیری: با بررسی نحوه‌ی توزیع ایزوله‌های جدا شده از نمونه‌های آب ورودی به هر یک از تصفیه‌خانه‌ها در خوشه‌ها، مشخص گردید که با توجه به تنوع بسیار بالای ژنتیکی ایزوله‌های مختلف E. coli که از منابع مختلف وارد آب شده‌اند، نمی‌توان الگوی خوشه‌ای خاصی را برای هر یک از تصفیه‌خانه‌ها در نظر گرفت .